Qui sommes nous ?
C’est au sein du laboratoire TBI qu’a été créé en 2002 le plateau d’Ingénierie et Criblage d’Enzymes Originales (ICEO), labellisé par INRAe, dédié à la découverte et à l’ingénierie d’enzymes et seule plateforme académique française spécialisée sur l’évolution moléculaire dirigée des protéines.
Si beaucoup d’enzymes sont déjà connues, il reste essentiel de découvrir et d’optimiser de nouvelles enzymes et activités enzymatiques afin de répondre aux besoins croissants de la biotechnologie, de la chimie, du développement durable et de l’industrie des sciences du vivant en général. Le criblage de la diversité naturelle passe par l’exploration des génomes et métagénomes pour découvrir de nouvelles enzymes, éventuellement en milieux particuliers et extrémophiles. En parallèle, les outils d’ingénierie enzymatique modernes permettent notamment de modifier de façon rationnelle ou aléatoire des enzymes connues pour les doter d’activités enzymatiques améliorées ou nouvelles afin de les optimiser à façon.
C’est pour tout cela que ICEO a développé des savoir-faire dans l’ingénierie des protéines, dans le criblage haut débit, dans la caractérisation et la purification d’enzymes et la création de diversité génétique.
Expertise / Offre
Conditions d'accès
L’offre de prestation est ouverte aux laboratoires de recherches publics ou privés. Un entretien préalable avec le responsable de la prestation permet de définir les contours de la prestation : type de prestation et stratégie expérimentale. Selon votre demande et la complexité du projet, la prestation peut se décliner selon trois types de modalités :
– Mise à disposition des équipements
– Prestation de services
– Contrat de collaboration
Des règles de confidentialité seront appliquées sur demande. Le plateau PICT-ICEO est certifié ISO 9001:2016 et NFX 50-900.
Equipements
Criblage à haut-débit
Automates de picking et d’organisation de colonies en format microplaques 96 ou 384 puits (Genetix; Kbiosystems), automates de transfert de liquide (Tecan; Hamilton), dispositif microfluidique pour criblage ultra-haut débit en gouttelettes (7pL), lecteurs de microplaques (UV/Vis, Fluorescence).
Purification et caractérisation biophysique des enzymes
Systèmes de purification FPLC ÄKTA; fluorimètre; dichroïsme circulaire; nanoDSF (NanoTemper).
Chromatographie analytique
Chaines HPLC (Thermo, Agilent) couplées avec détection UV/RI, Corona, ampérométrie ; GC et GC-MS; LC-MS dont un système ionique-masse.
Recherche & développement
Depuis sa création, PICT-ICEO s’appuie sur l’expertise et la masse critique développés au sein de l’axe Biocatalyse de TBI et travaille en lien étroit avec l’équipe Catalyse et Ingénierie moléculaire enzymatiques du prof. Magali Remaud-Simeon.
PICT-ICEO a pour mission de mettre à disposition de la communauté scientifique un ensemble de technologies et d’expertises permettant de faciliter l’acquisition de données fonctionnelles de cibles enzymatiques issues de programmes d’ingénierie rationnelle ou combinatoire, ou provenant de la biodiversité naturelle.
Notre activité scientifique participe ainsi
– à l’accroissement de la compréhension des liens entre diversité génique et fonctionnalité enzymatique,
– au développement d’approches intégrées d’analyse totale des enzymes, exploitant séquence, structure, dynamique et activité,
– à l’enrichissement des banques de données de structures 3D grâce à l’identification de configurations catalytiques originales issues des projets de métagénomique structurale ;
– à l’accélération de la construction de catalyseurs pour la biologie de synthèse et la construction de
nouvelles voies métaboliques.
Quelques projets bénéficiant du support de PICT-ICEO:
- CarbUniVax, Synergie entre synthèse chimique et ingénierie d’enzymes pour le développement de vaccins glycoconjugués à large spectre. ANR, 15-CE07-001. https://anr.fr/Projet-ANR-15-CE07-0019
- MetaFluidics, Advanced toolbox for rapid and cost-effective functional metagenomic screening – microbiology meets microfluidics. H2020, GA N° 685474. https://www.metafluidics.eu/
- DECO, Evolution des enzymes d’un PUL xylanolytique pour la conception de cocktails enzymatiques innovants. ANR, 18-CE43-0005. https://anr.fr/Projet-ANR-18-CE43-0005
- BioImpulse, Chimie biosourcée pour la production de colles non
toxiques. Biosourced chemistry for the production of non-toxic
adhesives. ADEME – PIA. https://bioimpulse.fr/
Infrastructure nationale et internationale
PICT-ICEO est un partenaire de l’infrastructure européenne/française IBiSBA «Industrial Biotechnology Innovation and Synthetic Biology Accelerator ». IBISBA, a pour ambition de fédérer les forces de R&D européennes pour créer une infrastructure de recherche dédiée au développement de la biotechnologie industrielle.
Au niveau français, IBISBA-FR conduit des projets de R&D finalisés et soutient ainsi l’émergence de la biotechnologie industrielle pour la valorisation du carbone renouvelable et donc de la bioéconomie. IBISBA-FR propose l’accès à plusieurs plateformes technologiques dédiées aux travaux bio-informatiques, à la construction à haut débit de souches, aux méthodes analytiques, aux opérations unitaires et aux bioconversions/fermentations, ainsi que deux autres plateformes dédiées à l’évaluation d’impacts environnementaux et à l’éthique pratique.
Au niveau européen, IBISBA.EU rassemble 14 partenaires de 9 pays européens, dont pour la France, le CEA, TWB, l’Insa Toulouse et l’Université de Nantes. Au cœur des ambitions d’IBISBA se trouve le l’objectif d’augmenter les interactions entre les laboratoires publics et la recherche industrielle afin d’accélérer la production de connaissances et leurs applications dans le domaine de la biotechnologie industrielle.
Contact
Sophie Bozonnet
Responsable ICEO / Ingénieur INRAe
Tél: +33 (0)5 61 55 94 88
Gianluca Cioci
Ingénieur INRAe
Tél : +33 (0)5 61 55 97 68
Sandra Pizzut-Serin
Ingénieur INRAe
Tél: +33 (0)5 61 55 94 88
Magali Remaud-Simeon
Dir. Scientifique ICEO, Prof. INSAT
Tél: +33 (0)5 61 55 94 46
